ภาพรวม

การตรวจยีนเนื้องอกชนิดแข็ง 671 ยีน (Solid Tumor 671 Gene Testing) เป็นบริการตรวจวิเคราะห์การจัดลำดับสารพันธุกรรมยุคใหม่ (NGS) ที่ตรวจวิเคราะห์ยีนที่เกี่ยวข้องกับมะเร็ง 671 ยีนจากตัวอย่างเนื้องอกเพียงชิ้นเดียว แทนที่จะตรวจสอบตัวบ่งชี้ทางชีวภาพทีละตัว ชุดตรวจนี้จะสแกนหาการกลายพันธุ์เฉพาะจุด (point mutations), การแทรกและการขาดหายของลำดับเบส (insertions and deletions), การเปลี่ยนแปลงจำนวนชุดยีน (copy-number changes) และการจัดเรียงตัวใหม่ของยีน (rearrangements) ที่คัดสรรมาทั่วทั้งจีโนม ผลลัพธ์ที่ได้คือแผนที่ระดับโมเลกุลที่ครอบคลุม ซึ่งช่วยให้แพทย์เห็นว่าวิถีการส่งสัญญาณใดที่เป็นตัวขับเคลื่อนโรคของผู้ป่วยอย่างแท้จริง สำหรับทีมแพทย์ด้านมะเร็งวิทยาที่ดูแลรักษาเนื้องอกชนิดแข็งที่ดื้อต่อการรักษาหรือจำแนกชนิดได้ยาก ความครอบคลุมนี้จะเปลี่ยนการวินิจฉัยที่ไม่ชัดเจนให้กลายเป็นรายการผลตรวจที่สามารถกำหนดเป้าหมายการรักษาได้อย่างเป็นรูปธรรม บริการนี้เหมาะสำหรับโรงพยาบาล ห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยา และทีมจัดซื้อที่ต้องการข้อมูลจีโนมที่ทำซ้ำและเชื่อถือได้โดยไม่ต้องดำเนินการศูนย์ตรวจหาลำดับสารพันธุกรรมของตนเอง

หลักการทำงาน

ขั้นตอนการทำงานเริ่มต้นด้วยการสกัดกรดนิวคลีอิกจากเนื้อเยื่อ FFPE, เนื้อเยื่อสด หรือ ctDNA ในพลาสมา การเตรียมไลบรารีจะเพิ่มปริมาณบริเวณเป้าหมายทั้ง 671 ยีน และการหาลำดับเบสจะดำเนินการบนแพลตฟอร์มที่มีปริมาณงานสูง (high-throughput) พร้อมความลึกของลำดับเบสที่ครอบคลุมเพื่อตรวจจับการกลายพันธุ์ที่มีความถี่ต่ำ จากนั้นระบบชีวสารสนเทศจะกำกับและอธิบายรายละเอียดของการเปลี่ยนแปลงแต่ละจุด กรองสัญญาณรบกวนของพันธุกรรมสายสืบพันธุ์ (germline noise) ออก และจัดอันดับผลการตรวจตามความเกี่ยวข้องทางคลินิก โดยทั่วไปจะใช้เวลาในการรายงานผลประมาณสองถึงสามสัปดาห์นับจากวันที่ได้รับตัวอย่าง เนื่องจากชุดตรวจนี้ตรวจวิเคราะห์ทั้งยีนกลายพันธุ์ขับเคลื่อนที่เป็นที่รู้จักดี เช่น EGFR, BRAF และ KRAS รวมถึงเป้าหมายใหม่ๆ รายงานเพียงฉบับเดียวจึงสามารถแสดงแนวทางการรักษาได้หลายแนวทางในคราวเดียว ความครอบคลุมนี้เป็นเหตุผลที่หลายโครงการเลือกใช้ชุดตรวจแบบครอบคลุมเป็นขั้นตอนการตรวจวิเคราะห์ระดับแรกก่อนที่จะตรวจยีนเดี่ยวตามลำดับ

ข้อบ่งใช้

บริการนี้รองรับผู้ป่วยผู้ใหญ่ที่มีเนื้องอกชนิดแข็งทุกประเภท ซึ่งการประเมินทางจีโนมอาจช่วยเป็นแนวทางในการรักษา—ไม่ว่าจะเป็นมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์เล็ก มะเร็งลำไส้ใหญ่และทวารหนัก มะเร็งเต้านม มะเร็งกระเพาะอาหาร มะเร็งท่อน้ำดี และเนื้องอกชนิดที่พบได้ยาก บริการนี้มีประโยชน์สูงสุดสำหรับผู้ป่วยที่ผลพยาธิวิทยามาตรฐานไม่พบทางเลือกการรักษาแบบมุ่งเป้าที่ชัดเจน ผู้ป่วยที่มีการดำเนินของโรคเพิ่มขึ้นหลังการรักษาเดิม หรือบุคคลที่กำลังได้รับการพิจารณาสำหรับการทดลองทางคลินิกที่ระบุตัวบ่งชี้ทางชีวภาพ แพทย์ยังใช้ข้อมูลนี้เพื่อประเมินภาวะบกพร่องของการซ่อมแซมดีเอ็นเอ (Homologous Recombination Deficiency) และสถานะ Mismatch Repair ซึ่งสามารถเพิ่มโอกาสในการเข้าถึงการรักษาด้วยยากลุ่ม PARP inhibitors และการรักษาด้วยภูมิคุ้มกันบำบัด การตรวจนี้จึงเหมาะสมในทุกกรณีที่ภาพรวมระดับโมเลกุลที่แม่นยำสามารถเปลี่ยนแนวทางการรักษาได้

ขนาดและวิธีการใช้

เนื่องจากนี่เป็นบริการตรวจวินิจฉัยไม่ใช่ยารักษาโรค จึงไม่มีการกำหนดขนาดยา สิ่งที่ต้องใช้ในแต่ละกรณี ได้แก่ แบบฟอร์มส่งตรวจทางพยาธิวิทยา (Pathology Request Form), หนังสือยินยอมที่ลงนามแล้ว และสไลด์ FFPE ที่ไม่ผ่านการย้อม 1 ถึง 3 แผ่น (หรือหลอดเก็บเลือด cfDNA ขนาด 10 มล.) รายงานผลจะถูกจัดส่งทางอิเล็กทรอนิกส์พร้อมตารางแสดงรายการการกลายพันธุ์ บทสรุปการแปลผล และเอกสารอ้างอิง แนะนำให้ตรวจซ้ำเฉพาะเมื่อโรคมีการดำเนินไปข้างหน้าหรือเมื่อมีตัวอย่างเนื้อเยื่อใหม่เท่านั้น

การจัดเก็บและการจัดหา

บล็อกชิ้นเนื้อ FFPE ควรเก็บไว้ที่อุณหภูมิ 2–8°C และจัดส่งพร้อมเจลเย็น ส่วนตัวอย่างพลาสมาต้องขนส่งที่อุณหภูมิ 2–8°C และนำไปดำเนินการโดยเร็ว บริการตรวจนี้จัดหาผ่านเครือข่ายผู้ผลิตที่ผ่านการตรวจสอบของ TreatmentsDrugs โดยมีเอกสารประกอบและใบรับรองการควบคุมคุณภาพ (QC) ให้ในแต่ละรอบการตรวจ ผู้ซื้อข้ามพรมแดนจะได้รับบรรจุภัณฑ์ที่สอดคล้องตามมาตรฐานการส่งออกพร้อมระบบติดตามการขนส่ง

คำถามที่พบบ่อย

ถาม: การตรวจยีน 671 ยีนแตกต่างจากการตรวจยีนเดี่ยวอย่างไร? ตอบ: การตรวจยีนเดี่ยวจะรายงานผลตัวบ่งชี้เพียงตัวเดียว ส่วนชุดตรวจ 671 ยีนจะสำรวจยีนกลายพันธุ์ขับเคลื่อนหลายร้อยตัวไปพร้อมกัน ซึ่งมักจะเผยให้เห็นแนวทางการรักษาหลายทางในรายงานฉบับเดียว

ถาม: รองรับตัวอย่างประเภทใดบ้าง? ตอบ: รองรับทั้งเนื้อเยื่อ FFPE, เนื้อเยื่อแช่แข็งสด และ ctDNA ในพลาสมา ซึ่งให้ความยืดหยุ่นเมื่อมีสิ่งส่งตรวจในปริมาณจำกัด

ถาม: ใช้เวลานานเท่าใดจึงจะได้รับผลตรวจ? ตอบ: กรณีส่วนใหญ่จะรายงานผลภายใน 2 ถึง 3 สัปดาห์นับจากวันที่ได้รับตัวอย่าง ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับคุณภาพของสิ่งส่งตรวจและความลึกของการวิเคราะห์ที่ต้องใช้

ถาม: รายงานผลสามารถช่วยในการจับคู่การทดลองทางคลินิกได้หรือไม่? ตอบ: ได้ รายการการกลายพันธุ์ที่มีคำอธิบายประกอบมักใช้เพื่อคัดกรองผู้ป่วยสำหรับการทดลองทางคลินิกที่ระบุตัวบ่งชี้ทางชีวภาพและโครงการขยายการเข้าถึงการรักษา (expanded-access programs)